こんちは。
Ubuntu14.04LTSにて、Rのバージョンを3.0.2のものを使っていたんだけど、
このバージョンだと利用できないパッケージ（ykmeans, arules・・・）がけっこうあるようだったので、バージョンアップしました。
現在（2016/12/10)の最新バージョンは、3.3.x です。
apt-get update ではRをバージョンアップできなかった
で、アプリケーションのバージョンアップをしようと、以下コマンドを実行したんだけど、Rのバージョンは3.0.2のままでバージョンアップできませんでした。
sudo apt-get update
Ubuntuのバージョンをアップグレードしました（14.04LTS → 16.04LTS）
結論ですが、Ubuntuのバージョンをアップグレード（14.04LTS → 16.04LTS）したら、Rのバージョンもアップグレード（3.0.2 → 3.2.3）されました。
Ubuntuを14.04LTSから16.04LTSへアップグレードする手順は、下記サイトを参考にしました。
Ubuntu 16.04LTSへアップグレードする
ぼくは何もトラブルは起きませんでしたが、大事な設定ファイルなどのデータはバックアップを取っておくことをオススメします。
※ぼくの場合は、アップグレードに３時間ほどかかりました
※途中、５〜６回ほど「yes/no」を選択する必要があるので、定期的に端末画面をチェックしたほうがいいです。ぼくは全て「yes」を選択しました。
Ubuntu14.04のままでもRをアップグレードできる方法があれば、教えていただけると幸いです。
以上です。
